数据集概述
本数据集为古蛋白质组学研究数据,包含用于中国白石崖溶洞和西班牙La Draga考古骨骼ZooMS分析的MALDI-ToF MS原始数据、合并光谱数据,以及用于将技术重复数据合并为单一msd文件的R代码,旨在通过优化消化时间提升大规模考古骨骼分析的可持续性。
文件详解
- 压缩文件(archive_files)
- 文件名称:msd files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含ZooMS分析的合并光谱数据文件(msd格式)
- 文件名称:mzML files.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含MALDI-ToF MS原始数据文件(mzML格式)
- 数据文件(data_files)
- 文件名称:Run20230210_RH9.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含Sample ID(样本编号)、Run Name(运行名称)、Replicate1(重复样本1)、Replicate2(重复样本2)、Replicate3(重复样本3)字段,记录样本与技术重复的对应关系
- 代码文件(code_files)
- 文件名称:ZooMS_merging_script.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于将技术重复数据合并为单一msd文件的R脚本代码
数据来源
论文“Increasing sustainability in palaeoproteomics by optimizing digestion times for large-scale archaeological bone analyses”(DOI: 10.1016/j.isci.2024.109432)
适用场景
- 古蛋白质组学方法优化: 研究不同消化时间对考古骨骼ZooMS分析效率与可持续性的影响
- 考古骨骼物种鉴定: 利用MALDI-ToF MS数据进行考古遗址骨骼样本的物种分类与鉴定
- 质谱数据处理方法开发: 基于R代码优化技术重复数据的合并策略,提升数据处理效率
- 大规模考古样本分析: 为批量考古骨骼样本的古蛋白质组学分析提供可持续的实验方案参考