固氮根瘤菌GC_MS代谢组学数据集

数据集概述

本数据集包含固氮根瘤菌(Azorhizobium caulinodans)在13C4标记的琥珀酸培养基中,于不同生长条件下(包括有氧、微氧、固氮培养以及从Sesbania rostrata根瘤中分离的类菌体)进行培养后,通过气相色谱-质谱联用技术获得的代谢组学数据。数据可用于研究该菌的中央碳代谢通量和代谢适应机制。

文件详解

  • 样本信息文档
  • 文件名称: Sample IDs.docx
  • 文件格式: DOCX
  • 字段映射介绍: 记录各实验样本的标识信息,可能对应不同的生长条件或生物学重复。
  • 代谢物同位素分布数据
  • 文件名称: Extracted MIDs GC-MS.xlsx
  • 文件格式: XLSX
  • 字段映射介绍: 包含从GC-MS原始数据中提取的代谢物同位素分布信息,用于定量分析13C标记在代谢物中的富集情况。
  • GC-MS原始数据归档
  • 文件名称: GC-MS Raw files.zip
  • 文件格式: ZIP
  • 字段映射介绍: 压缩文件,内含气相色谱-质谱联用仪采集的原始数据文件,需专用软件(如Chromeleon, MassHunter等)打开和分析。

适用场景

  • 微生物代谢通量分析: 利用13C标记数据和MIDs信息,定量研究固氮根瘤菌在不同生理条件下的中央碳代谢网络流量。
  • 环境适应性代谢研究: 比较有氧、微氧、固氮等不同生长条件下菌体的代谢谱差异,揭示其代谢适应策略。
  • 植物-微生物互作研究: 分析从根瘤中分离的类菌体的代谢状态,探讨共生固氮过程中的代谢互馈机制。
  • 代谢组学数据分析方法开发: 作为标准数据集,用于开发和验证新的GC-MS数据处理、MIDs提取或通量分析算法。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 39.1 MiB
最后更新 2025年11月26日
创建于 2025年11月26日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。