数据集概述
本数据集围绕茄属植物（多毛番茄与栽培番茄）种间渐渗系的全基因组转录调控分化机制展开，包含基因表达数据及处理脚本。通过分析四种组织（茎尖、成熟果实、花粉、种子）的表达模式，探究顺式与反式调控变化的贡献，以及渐渗区域与背景基因的表达差异，为植物表型进化的遗传基础研究提供数据支持。
文件详解
- 文件名称：
README_for_Leaf_sun_expression.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含叶片基因表达RNA-Seq数据集的来源说明、下载路径（加州大学戴维斯分校Sinha实验室网站、iPlant仓库）及数据处理流程（shell脚本与R代码的使用说明）
- 文件名称：
Guerrero_etal_scripts.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含用于数据处理的脚本文件，包括shell脚本和R代码（如
Guerrero_etal_source.R中的leaf_preprocess代码块）
- 文件名称：
Leaf_sun_expression.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含叶片基因表达数据，预览内容显示以渐渗系编号（如IL1.1.2_1、IL1.1.3_1等）为表头的表达量相关数据
数据来源
Sinha Lab website at UC Davis、iPlant repository
适用场景
- 植物转录调控进化研究：分析茄属种间顺式与反式调控变化对基因表达分化的贡献
- 渐渗系基因表达模式分析：探究渐渗区域与背景基因的表达差异及组织特异性
- 植物表型进化遗传基础研究：验证调控分化与表型进化的关联机制
- 基因组学数据处理方法参考：学习利用shell脚本与R进行RNA-Seq数据预处理的流程
