果蝇帕金森病模型代谢物分析数据集

数据集概述

本数据集围绕果蝇帕金森病模型的代谢物分析展开,包含使用四种液相色谱质谱方法测量的不同背景(野生型、Adk1敲除、突触核蛋白表达或对照)果蝇脑内代谢物丰度数据,旨在识别胶质细胞相关治疗靶点。

文件详解

  • 数据文件:
  • 22_0322_alphaSyn_fly_pilot_Classes.xlsx:Excel格式,包含代谢物谱数据
  • dup_metabs_decision.csv:CSV格式,定义重复检测代谢物的选用规则,字段包括Method(检测方法)、Decision(选用决策)、Compound_ID(化合物ID)、Metabolite(代谢物名称)等
  • 代码文件:
  • 位于code/目录,包含R脚本(如common_functions.R)、R Markdown文件(如volcano_plots_just_knowns.Rmd、pca_just_knowns.Rmd)
  • 结果文件:
  • 位于results/目录,包含PDF格式图表(如pca_knowns_HP-HN-CP-CN.pdf)、HTML格式报告(如volcano_plots_just_knowns.html)

适用场景

  • 帕金森病代谢组学研究:分析不同遗传背景下果蝇脑内代谢物变化
  • 胶质细胞治疗靶点筛选:探究腺苷代谢等胶质细胞相关通路的治疗潜力
  • 质谱数据分析方法验证:验证液相色谱质谱多方法联合分析的可靠性
  • 神经退行性疾病机制研究:通过果蝇模型解析帕金森病病理生理机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.6 MiB
最后更新 2025年12月5日
创建于 2025年12月5日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。