数据集概述
本数据集为饮食诱导肥胖相关研究的补充表格数据，包含5个文件，记录了造血干细胞和祖细胞（HSPCs）中氧化应激重塑H3K4me3修饰的相关分析结果，涉及正常饮食（ND）、低脂饮食（LFD）与高脂饮食（HFD）条件下的基因表达及表观遗传变化，用于支持非 resolving 髓系生成机制的研究。
文件详解
- 差异分析表格（CSV格式）
- 文件名称：
Table1_PLX032702_volcano_plot_v2_ND_GMP_vs_LSK.csv、Table2_PLX032702_volcano_plot_v2_HFD_GMP_vs_LSK.csv、Table3_LSK_PLX259429_volcano_plot_v2_H3K4me3_HFD_vs_H3K4me3_LFD.csv、Table4_GMP_PLX176062_volcano_plot_v2_H3K4me3_HFD_vs_H3K4me3_ND.csv
- 文件格式：CSV
- 字段映射介绍：包含peak_id（峰ID）、Gene_Symbol（基因符号）、Average_Expression（平均表达量）、Log2_Fold_Change（对数2倍变化）、P_Value（P值）、Adj_P_Value（校正P值，部分文件含）、Average_ZscoreLog2CPM_Experimental/Control（实验组/对照组平均Z评分对数2每百万读数）、Median_ZscoreLog2CPM_Experimental/Control（实验组/对照组中位数Z评分对数2每百万读数）等差异分析指标
- 造血相关基因表格（XLSX格式）
- 文件名称：
Table5_Curated_ATAC_Genes_hematopoiesis.xlsx（注：输入中文件样本显示为Table5_ATAC_Genes_hematopoiesis.xlsx，此处以实际样本为准）
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：为造血相关基因的整理表格，具体字段未完全展示，推测包含造血相关基因的注释信息
数据来源
论文“Oxidative Stress-Remodeled H3K4me3 in Hematopoietic Stem and Progenitor Cells Drives Non-Resolving Myelopoiesis in Diet-induced Obesity”
适用场景
- 肥胖相关表观遗传机制研究：分析高脂饮食下造血干细胞H3K4me3修饰的变化规律
- 造血系统基因表达分析：探究正常饮食与高脂饮食条件下GMP与LSK细胞的基因表达差异
- 髓系生成调控机制研究：通过差异分析数据解析非 resolving 髓系生成的驱动因素
- 生物信息学差异分析验证：为氧化应激相关基因表达及表观修饰的差异分析提供原始数据支持
