数据集概述
本数据集为濒危海草物种Halophila johnsonii的系统发育分析比对数据，包含其与近缘种H. ovalis的DNA序列、全基因组SNP及微卫星数据，用于解决H. johnsonii的分类地位与亲缘关系问题，共含5个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：Halophila_johnsonii_phylogenetic_analysis_alignments_readme.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：数据集说明文档，包含数据背景、研究目的、文件说明等信息
- 元数据文件
- 文件名称：Metadata_Halophila_johnsonii_phylogenetic_analysis_samples.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：样本元数据表格，包含Halophila johnsonii及H. ovalis样本的采集信息、分类信息等
- 比对文件（.nex格式）
- 文件名称：Waycott_hybcap_16plastidloci_alignmentall.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：16个质体基因座的序列比对数据
- 文件名称：Waycott_hybcap_7nuclearloci_alignmentall.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：7个低拷贝核基因座的序列比对数据
- 文件名称：Waycott_ddRAD_990loci_alignementall.nex
- 文件格式：NEX
- 字段映射介绍：990个ddRAD SNP位点的序列比对数据
适用场景
- 濒危物种分类地位研究: 分析Halophila johnsonii与H. ovalis的亲缘关系，确定其分类地位
- 植物系统发育分析: 利用质体、核基因及SNP数据构建系统发育树，解析物种演化关系
- 种群遗传学研究: 基于微卫星和SNP数据开展种群遗传多样性与克隆结构分析
- 生物入侵溯源: 探究Halophila johnsonii的地理起源与扩散路径，支持入侵物种管理决策
- 保护生物学应用: 依据遗传分析结果制定濒危海草物种的保护策略与栖息地管理方案
