数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB777品系(hcf-1(ok559)IV基因突变体)成年雌雄同体线虫在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养基中的行为实验数据,包含实验元信息、视频追踪数据及特征提取结果,可用于线虫基因功能与行为表型关联研究。
文件详解
- 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_15__12_3935.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:可能包含线虫行为轨迹的标准化数据文件(WCON格式),记录线虫运动的时空坐标等基础轨迹信息
- 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_15__12_3935.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储实验原始追踪数据,可能包含21281个分割骨架的时空坐标、帧率(约每秒24帧)、像素分辨率(每像素约4.57微米)等基础参数
- 文件名称:hcf-1 (ok559)IV on food L_2011_09_15__12_3935_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动速度、弯曲度、摆尾频率等表型特征参数
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究:分析hcf-1基因缺失对成年线虫觅食行为、运动模式等表型的影响
- 模式生物行为学分析:基于标准化轨迹数据探究线虫行为的量化特征与遗传背景的关联
- 行为实验方法验证:参考E. Yemini等的实验方案,验证线虫行为学实验的可重复性
- 生物信息学工具应用:测试tierpsy等线虫行为追踪软件的特征提取效果与数据兼容性