数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了HE130品系(unc-98(su130)X基因突变)成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM低蛋白胨琼脂培养皿中进行,使用tierpsy软件追踪分析,包含视频原始数据、行为特征数据及标准化格式文件,可用于线虫基因突变与行为表型的关联研究。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:unc-98 (su130)X on food R_2010_08_19__12_1536.hdf5
- 格式:HDF5
- 说明:存储线虫行为实验的原始追踪数据,包含21586个分段骨架信息,记录线虫运动的空间坐标及时序变化
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:unc-98 (su130)X on food R_2010_08_19__12_1536_features.hdf5
- 格式:HDF5
- 说明:存储经tierpsy软件提取的线虫行为特征数据,包含运动轨迹、速度、身体弯曲度等量化指标
- 标准化格式文件(.zip格式)
- 文件名称:unc-98 (su130)X on food R_2010_08_19__12_1536.wcon.zip
- 格式:ZIP(内含wcon格式文件)
- 说明:以标准化wcon格式存储的线虫行为数据,便于跨平台共享与分析
数据来源
C. elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫遗传学研究:分析unc-98基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响
- 行为表型分析:通过追踪数据量化线虫的运动轨迹、速度等行为特征
- 实验方法验证:参考E. Yemini等人的实验方法,复现或优化线虫行为实验设计
- 生物信息学工具测试:用于验证tierpsy等线虫行为追踪软件的分析效果
- 模式生物数据库补充:作为秀丽隐杆线虫行为数据库的组成部分,支持大规模行为组学研究