数据集概述
本数据集聚焦不同气候水域的水生变温动物热适应与驯化机制,通过红带鳟鱼(沙漠与山地种群)的共同园热应激实验,包含热休克基因表达、SNP基因型及候选基因列表等数据,为研究热适应进化机制及气候变化影响提供支持。
文件详解
- Heat_Shock_Gene_Expression.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:记录沙漠与山地红带鳟鱼肝脏组织中6个热休克基因(hsf1b、hsp27、hsp47、hsp90、hsf2、hsp70)的表达数据,包含样本编号、处理/对照状态、采集日期、体重、种群等基础信息
- SNP_Genotypes_PLINKinput.ped.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:PLINK输入格式的SNP基因型数据,用于全基因组关联分析,包含与热应激存活相关的SNP位点信息
- Narum et al. SNP list.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:候选SNP位点列表,包含热应激适应相关的关键基因(如Hsp47)及对应SNP信息
数据来源
论文“Thermal adaptation and acclimation of ectotherms from differing aquatic climates”
适用场景
- 热适应进化机制研究: 分析沙漠与山地红带鳟鱼热休克基因表达差异及SNP关联,探究热适应的遗传基础
- 气候变化适应性预测: 利用候选SNP位点,预测物种在气候变化场景下的适应潜力
- 水生生物应激生理学研究: 研究热休克蛋白表达与短期/长期存活的生理成本平衡机制
- 分子生态学应用: 基于种群遗传数据,分析不同气候区域水生生物的适应性分化模式