数据集概述
本数据集围绕树沙螽（Hemideina crassidens）种群内线粒体DNA序列差异展开，包含蛋白编码区（cytb/ND1）单倍型、全线粒体基因组及核基因座数据，用于分析种群内高线粒体序列差异的成因，验证遗传多样性保留机制。
文件详解
- 文件名称：Cytb-ND_rangi_29.phy
- 文件格式：.phy
- 字段映射介绍：包含树沙螽种群cytb/ND1蛋白编码区的线粒体DNA单倍型序列数据，用于分析种群内序列差异。
- 文件名称：Hemideina_crassidens_mtDNAgenomes.fasta.gz
- 文件格式：.fasta.gz
- 字段映射介绍：压缩格式的树沙螽全线粒体基因组序列数据，来自两个代表性个体，用于检测选择约束证据。
- 文件名称：nuclear markers_table.xlsx
- 文件格式：.xlsx
- 字段映射介绍：包含5个核基因座的基因型数据表格，用于分析种群交配模式及核标记与线粒体分组的关联性。
数据来源
论文“Explaining large mitochondrial sequence differences within a population sample”
适用场景
- 线粒体DNA遗传多样性研究: 分析树沙螽种群内线粒体序列差异的成因及遗传多样性保留机制。
- 物种界定方法验证: 探讨非重组基因历史导致的mtDNA聚类对物种界定的潜在误导性。
- 选择约束分析: 利用全线粒体基因组数据检测树沙螽线粒体基因的选择压力。
- 种群遗传学研究: 通过核基因座数据验证种群交配模式及核质遗传关联性。
