数据集概述
本数据集为HER2驱动乳腺癌触发抗Yo副肿瘤性小脑变性（Yo-PCD）相关研究的补充表格与基因表达数据，包含差异基因表达分析结果、基因本体富集分析结果及基因计数、转录本每百万读数（TPM）数据，共5个文件，支持对该疾病免疫遗传机制的深入研究。
文件详解
- 差异基因表达分析结果
- 文件名称：eTable 1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含DESeq2分析Yo-PCD肿瘤与对照肿瘤的所有基因及差异表达基因的结果
- 基因本体富集分析（过表达基因）
- 文件名称：eTable 2.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：clusterProfiler对Yo-PCD肿瘤中过表达基因的Gene Ontology富集结果
- 基因本体富集分析（低表达基因）
- 文件名称：eTable 3.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：clusterProfiler对Yo-PCD肿瘤中低表达基因的Gene Ontology富集结果
- 基因计数数据
- 文件名称：gene_count.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含基因名称（如A1BG）及对应样本（如13A、12、14等）的基因计数数据
- 基因TPM数据
- 文件名称：gene_TPM.tsv
- 文件格式：TSV
- 字段映射介绍：包含基因名称（如A1BG）及对应样本（如13A、12、14等）的转录本每百万读数（TPM）数据
数据来源
论文“Immune and genetic signature of HER2-driven breast carcinomas triggering anti-Yo paraneoplastic cerebellar degeneration”
适用场景
- 肿瘤免疫遗传机制研究：分析Yo-PCD相关HER2驱动乳腺癌的差异基因表达特征及免疫相关通路
- 基因本体功能富集分析：探索Yo-PCD肿瘤中过表达/低表达基因的生物学功能与通路
- 生物标志物筛选：基于差异基因表达结果识别Yo-PCD相关的潜在生物标志物
- 基因表达定量分析：利用gene_count.tsv和gene_TPM.tsv进行基因表达水平的定量研究与验证
