HGSC宫颈样本拷贝数分析与HCsig预测数据集

数据集概述

本数据集包含高级别浆液性卵巢癌(HGSC)检测相关的浅全基因组测序处理数据,围绕宫颈样本拷贝数变异(CNAs)分析构建HCsig预测模型展开,涉及不同分期HGSC患者及健康人群的样本数据,支持HGSC早期检测研究。

文件详解

该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 核心数据文件(按目录分类): - 50kb_segmentation目录:包含50kb分辨率的分段文件(.tsv格式) - 50kb_hg19_Rascal_absolute_CN/50kb_hg38_Rascal_absolute_CN目录:包含基于hg19和hg38参考基因组的50kb分辨率绝对拷贝数文件(.tsv格式) - 50kb_CN_features_matrix.txt:CN特征矩阵文件(.txt格式) - MaNiLaMasterFile_250130.xlsx:元数据文件(.xlsx格式) - 质控结果文件(QC_results目录): - multiqc_seqonly_2021_047_DNA_report.html/multiqc_seqonly_2021_072-seqonly_report.html:质控报告文件(.html格式) - 子目录包含质控统计数据文件(如multiqc_general_stats.txt、multiqc_fastqc.txt等,.txt格式)

适用场景

  • 肿瘤学研究:分析HGSC患者宫颈样本中的拷贝数变异特征
  • 生物信息学应用:验证HCsig预测模型在HGSC早期检测中的效能
  • 临床转化研究:探索宫颈样本在卵巢癌筛查中的潜在价值
  • 基因组学分析:研究浅全基因组测序数据处理及拷贝数变异检测方法
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 788.6 MiB
最后更新 2025年11月29日
创建于 2025年11月29日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。