数据集概述
本数据集来自欧洲樱桃果蝇(Rhagoletis cerasi)Wolbachia感染动态的15年调查研究,包含欧洲范围内该昆虫体内Wolbachia菌株(wCer1、wCer2)的时空分布及德国地区相关线粒体单倍型数据,用于分析CI驱动的选择清除、菌株扩散及水平传播机制。
文件详解
- 遗传分析数据文件
- 文件名称:Rc Micros D GenAlEx.xls
- 文件格式:XLS
- 字段映射介绍:可能包含樱桃果蝇微卫星标记的基因型数据,用于群体遗传结构分析,支持计算遗传多样性、群体分化等指标
- 压缩文件包
- 文件名称:Fstat.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:可能包含用于Fstat软件分析的群体遗传学原始数据或结果文件
- 文件名称:Microsat_FragAnalysis_rawdata.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:可能包含微卫星片段分析的原始实验数据
- 文件名称:Sequences.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:可能包含线粒体或Wolbachia相关基因的核苷酸序列数据
- 文件名称:Structure.zip
- 文件格式:ZIP
- 内容说明:可能包含用于Structure软件分析群体遗传结构的输入或输出数据
适用场景
- 昆虫共生菌研究:分析Wolbachia在樱桃果蝇自然种群中的感染率、菌株分布及时空动态
- 群体遗传学分析:利用微卫星和序列数据研究果蝇种群的遗传结构与分化
- 线粒体选择清除机制研究:探讨CI驱动的wCer2菌株扩散对线粒体单倍型的选择效应
- 水平传播机制分析:基于过渡区菌株与单倍型的非关联数据,研究Wolbachia的水平传播频率及稳定性
- 生物入侵动态模拟:通过时空分布数据模拟wCer2菌株在欧洲的扩散过程与过渡区形成机制