数据集概述
本数据集包含HIV-1逆转录酶(RT)二聚体解离突变体p66_L289K的NMR质子顺磁弛豫增强(PRE)数据及基于小角X射线散射(SAXS)的结构模型,通过Xplore计算的最终结构模型也在此存档,SAXS部分将单独提交至SAXSDB。
文件详解
该数据集包含多个目录及文件,具体说明如下:
- 根目录(7vrvryyghx-2/):包含PRE数据与结构模型两个子目录
- PRE数据目录(7vrvryyghx-2/PRE data/):
- 说明文档:PRE data/README.docx(DOCX格式)
- 突变体子目录(按突变位点划分,如L289K-A534C/、L289K-E291C/等):每个子目录下包含三类FT2格式文件:
- [突变体]_ref.ft2:参考数据文件
- [突变体]_MTSL.ft2:MTSL标记数据文件
- [突变体]_dMTSL.ft2:去MTSL标记数据文件
- 结构模型目录(7vrvryyghx-2/Structural model/):
- 说明文档:fit_information.docx(DOCX格式)
- 结构模型文件:10个PDB格式文件(如1_Model_82.pdb、6_Model_37.pdb等)
适用场景
- 结构生物学研究:分析HIV-1 RT突变体的空间构象及二聚体解离机制
- 药物研发:基于突变体结构模型设计针对HIV-1逆转录酶的新型抑制剂
- 生物物理分析:探究质子顺磁弛豫增强技术在蛋白质结构解析中的应用
- 计算生物学:验证Xplore软件在整合SAXS与NMR数据构建结构模型的可靠性