数据集概述
本数据集通过GeoMx DSP平台和HTG平台生成，包含HLposHIVnegEBVneg、HLposHIVposEBVpos、HLposHIVnegEBVpos三类霍奇金淋巴瘤（HL）供体样本的空间分子谱数据，对感兴趣区域（ROI）进行空间分析以捕捉不同供体类别的分子特征，共9个文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称：GeoMx_README.odt
- 文件格式：ODT
- 字段映射介绍：GeoMx平台实验相关说明文档
- 文件名称：HTG README.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：HTG平台实验相关说明文档
- 数据类文件
- 文件名称：Anonimized_Donors_HTG.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：HTG平台匿名供体信息数据
- 文件名称：Anonimized_GeoMx_Hodgkin_HIV_Annotation template file.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：GeoMx平台样本注释模板数据
- 文件名称：geomx donors anonymized.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：GeoMx平台匿名供体信息数据
- 文件名称：Anonimized_GeoMx_Hodgkin_HIV_Initial Dataset.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：GeoMx平台初始数据集
- 文件名称：Anonimed_GeoMx_Hodgkin_HIV_Normalization_Q3_all targets_1.6.22.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：GeoMx平台标准化处理后数据集
- 文件名称：GeoMx anonymized donors.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：GeoMx平台匿名供体信息数据
- 文件名称：HTG_Immune_response_QualityControlled_anonymized.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：HTG平台免疫反应质控后匿名数据集
适用场景
- 肿瘤免疫微环境研究: 分析HIV感染状态对霍奇金淋巴瘤肿瘤微环境适应性免疫反应的影响
- 分子特征谱分析: 基于GeoMx和HTG平台数据，挖掘不同供体类别的空间分子表达特征
- 免疫反应机制研究: 探索HIV感染与EBV状态对霍奇金淋巴瘤免疫反应的调控机制
- 医疗数据标准化参考: 利用标准化处理数据集，为肿瘤免疫相关数据标准化提供参考
- 实验平台对比分析: 对比GeoMx DSP与HTG平台在肿瘤免疫分子分析中的应用效果
