数据集概述
本数据集包含人类单纯疱疹病毒1型(HSV-1)和2型(HSV-2)的基因组相关数据,用于研究两者间的古老重组事件及HSV-2的进化历史。数据支持分析HSV-2的两个主要谱系(撒哈拉以南非洲谱系和全球分布谱系)特征,以及全球谱系与HSV-1的重组机制,共包含2个压缩文件。
文件详解
- 文件名称:alignments.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,推测包含HSV病毒基因组序列的比对数据,用于重组事件和系统发育分析的基础序列比对文件
- 文件名称:annotated_genomes.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,推测包含已注释的HSV病毒基因组数据,可能包含基因结构、功能注释等信息,用于基因组层面的重组特征分析
数据来源
论文“Ancient recombination events between human herpes simplex viruses”
适用场景
- HSV病毒进化历史研究: 分析HSV-2的两个主要谱系(撒哈拉以南非洲谱系和全球分布谱系)的起源与扩散路径
- 病毒重组事件分析: 研究HSV-2全球谱系与HSV-1的古老重组机制及其对病毒进化的影响
- 病毒基因组功能研究: 基于注释基因组数据,探索重组事件对病毒基因功能和表型的潜在影响
- 病毒感染监测: 为HSV-1和HSV-2共感染的基因组后果研究提供数据支持,指导临床监测方向