数据集概述
本数据集包含环带环节动物NaK基因复制研究相关的生物信息学数据文件与分析脚本，用于支持相关学术出版物的研究工作，涵盖物种序列数据、系统发育分析配置及数据处理代码。
文件详解
- 系统发育分析数据文件（.phy格式）：
- annelidonly_species_min10_filtered_concat.phy：仅包含环带环节动物的过滤后物种序列数据
- molluskoutgroup_species_min10_concat.phy：包含软体动物外类群的物种序列数据
- 分析配置文件（.txt格式）：
- molluskoutgroup_min10_raxml_partition.txt：软体动物外类群分析的RAxML分区配置，含进化模型（如LG、JTT）与序列分区范围
- annelidonly_filtered_raxml_partition.txt：环带环节动物过滤数据的RAxML分区配置
- 数据处理脚本（.R格式）：
- LB_PD_filter.R：R语言数据过滤脚本
- 节点处理脚本（.py格式）：
- node_collapse.py：Python节点折叠处理脚本
适用场景
- 分子生物学研究：分析环带环节动物NaK基因家族的进化历史
- 系统发育分析：构建包含软体动物外类群的物种进化树
- 生物信息学方法验证：复现基因复制事件的检测与分析流程
- 比较基因组学：探究环节动物与软体动物的基因序列差异
