黄尾鰤染色体图谱构建与染色体重排比较分析实验数据集

数据集概述

该数据集为黄尾鰤(Seriola quinqueradiata)染色体图谱构建及染色体重排比较分析的实验数据,包含多种格式的关联文件,为研究鱼类染色体结构与进化提供数据支持。

文件详解

  • Readme.txt:文本格式,包含数据集说明及文件指引
  • RHmap.pdf:PDF格式,完整的辐射杂交(RH)图谱文件
  • 共线性分析文件(.xlsx格式):
  • gar_stickleback_synteny_one_sheet.xlsx:斑点雀鳝与三刺鱼的共线性数据,斑点雀鳝cDNA ID位于A列,位置信息在B-D列;比较物种cDNA ID在E列,位置在F-G列
  • gar_tetraodon_synteny_one_sheet.xlsx:斑点雀鳝与河豚的共线性数据,字段分布同上述文件
  • gar_yellowtail_synteny_one_sheet.xlsx:斑点雀鳝与黄尾鰤的共线性数据,字段分布同上述文件
  • gar_medaka_synteny_one_sheet.xlsx:斑点雀鳝与青鳉的共线性数据,字段分布同上述文件
  • v532_scaf_ALL:无扩展名文件,Carthagene软件输出结果
  • anchoring.zip:压缩格式,锚定相关数据归档文件
  • scaffolds_on_chrom.xlsx:Excel格式,各染色体上的 scaffolds 序列列表
  • primer_list.xlsx:Excel格式,本研究中设计的引物信息

适用场景

  • 鱼类染色体进化研究:分析黄尾鰤与其他鱼类的染色体重排模式
  • 比较基因组学分析:探索不同鱼类物种间的染色体共线性关系
  • 分子标记开发:基于引物数据开展黄尾鰤遗传标记相关研究
  • 染色体图谱构建:利用RH图谱及scaffolds锚定数据完善鱼类染色体图谱
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 4.83 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。