数据集概述
本数据集基于基因分型测序（GBS）技术，对162份胡萝卜属及近缘属材料进行分析，获取覆盖9条染色体的单核苷酸多态性（SNP）数据，用于探究胡萝卜亚种的系统发育关系与分类，验证GBS技术在亚种鉴别中的有效性。
文件详解
- 基因型数据文件：
- SNP data set_Daucus_0.1 missing data_Arbizu et al.nex：NEX格式，含缺失率10%的18,565个SNP数据，覆盖150份胡萝卜属材料
- SNP data set_Daucus_0.3 missing data_Arbizu et al.nex：NEX格式，含缺失率30%的43,713个SNP数据，覆盖150份胡萝卜属材料
- 辅助图表文件（PDF格式）：
- Additional file 3 Figure S1.pdf、Additional file 5 Figure S3.pdf等11份文件：包含系统发育树、群体结构分析等实验结果图表，展示亚种分类及亲缘关系可视化结果
适用场景
- 植物系统发育研究：分析胡萝卜属物种及亚种的亲缘关系与进化路径
- 分子分类学应用：验证GBS技术在植物亚种鉴别中的可行性与准确性
- 作物起源研究：探究栽培胡萝卜与野生胡萝卜的演化关系及地理起源
- 遗传多样性分析：评估胡萝卜属不同地理群体的遗传变异水平与结构特征
