数据集概述
本数据集围绕混合病毒感染对多分体黄瓜花叶病毒（CMV）基因组公式的影响展开，包含qPCR测定的基因组公式、病毒滴度等实验数据，以及用于模拟感染机制的模型代码和分析文件，为研究病毒基因组变化提供支持。
文件详解
- 数据文件（.csv格式）：
- MixedInfectionsPhenotypes.csv：包含样本处理、宿主物种、症状、株高、株重等表型数据
- GF_all_replicates.csv：所有重复样本的基因组公式（GF）数据
- Accumulation_DF_AMVPVY.csv：AMV和PVY病毒的积累量数据
- Accumulation_DF_CMV.csv：黄瓜花叶病毒（CMV）的积累量数据
- 模型代码文件（.R格式）：
- Model Scenario 1 Coopting gene products v3.R：基因产物协同利用模型代码
- Model Scenario 2 Coinfection exclusion v3.R：共感染排斥模型代码
- Model Scenario 3 Coinfection exclusion two host cell subpopulations v3.R：双宿主细胞亚群共感染排斥模型代码
- 分析代码与报告文件：
- Empirical_PlotsANOVA.Rmd：ANOVA分析及绘图的RMarkdown源文件
- Empirical_PlotsANOVA.html：ANOVA分析结果的HTML报告
- Analysis GF results mixed infections v4.R.txt：基因组公式结果分析的R代码文本
- 说明文件：
- README_DB_MixedInfections_final.txt：数据集总体说明文档
适用场景
- 病毒学研究：分析混合感染对多分体病毒基因组组成的调控机制
- 分子生物学实验：验证qPCR技术在病毒滴度与基因组公式测定中的应用
- 生物信息学建模：基于实验数据优化病毒感染过程的数学模拟模型
- 植物病理学分析：探究病毒混合感染对宿主表型（症状、生长）的影响
- 统计方法应用：通过ANOVA等方法分析不同处理组间的基因组公式差异
