火炬松基因组BAC测序与Cot分析补充文件集

数据集概述

本数据集为火炬松(Pinus taeda L.)基因组BAC测序与Cot分析研究的补充文件,包含实验方案、靶向基因列表、筛选流程示意图、宏阵列筛选示例及测序BAC克隆信息,支持研究的可重复性与细节验证。

文件详解

  • 文件1:Additional File 1.pdf(PDF格式),含六项实验详细方案:植物核DNA分离、核酸溶液透析、DNA片段化处理、金属离子去除、磷酸钠缓冲液及ASE缓冲液制备。
  • 文件2:Additional File 2.xls(XLS格式),列出七十三条靶向基因(碳代谢、木材发育等)的过go探针序列、参考文献,分两批(二十五条、四十八条)用于BAC宏阵列筛选。
  • 文件3:Additional File 3.pptx(PPTX格式),含BAC筛选步骤示意图:筛选大纲与池化模式。
  • 文件4:Additional File 4.pptx(PPTX格式),展示两批4×4宏阵列筛选示例,含阳性克隆坐标对应关系、重复元件杂交及NotI酶切验证结果。
  • 文件5:Additional File 5.xls(XLS格式),记录一百条测序BAC克隆信息:GenBank登录号、基因索引、组装长度、克隆类型、筛选探针、基因组 scaffold ID及查询覆盖度。

适用场景

  • 基因组学研究:支持火炬松基因组结构与功能分析的实验方法参考
  • 分子生物学实验:提供BAC筛选、核酸处理等标准化实验方案
  • 植物遗传学:辅助靶向基因克隆与基因组区域验证研究
  • 生物信息学:为BAC测序数据解读与分析提供背景信息支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 1.55 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
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