数据集概述
本数据集为小麦(Triticum aestivum L.)在热胁迫(HS)下的时空转录组图谱数据,通过混合测序技术(单分子全长测序+Illumina短读长测序)生成,包含旗叶和灌浆籽粒在0分钟、5分钟、10分钟、30分钟、1小时、4小时热胁迫下的转录组信息,新发现4,947个基因座和70,285个转录本,补充了小麦参考基因组注释。
文件详解
- 序列与注释文件包
- 文件名称:sequence_and_annotation.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含小麦热胁迫响应相关的序列数据及注释信息,可能涵盖新发现的基因座、转录本序列与结构注释等内容
- 基因转录本FPKM文件包
- 文件名称:Genes_transcripts_FPKM.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容说明:包含基因和转录本的FPKM(每千碱基转录本每百万映射读取数)表达量数据,反映热胁迫不同时间点的基因表达水平
适用场景
- 小麦热胁迫响应机制研究:分析热胁迫下基因表达的时空动态变化,揭示小麦感知热信号与传导的分子机制
- 小麦抗逆基因挖掘:基于新发现的转录本数据,筛选热胁迫响应关键基因,为抗热育种提供靶点
- 小麦基因组注释完善:利用新发现的基因座和转录本信息,补充和优化现有小麦参考基因组的注释内容
- 作物抗逆转录组分析方法验证:验证混合测序技术在多倍体作物复杂转录组研究中的应用效果