数据集概述
本数据集围绕新热带界塞拉多稀树草原特有树蛙Hypsiboas lundii展开,结合基因组SNP数据、线粒体DNA及第四纪古气候分布模型,分析古气候波动对其种群结构和遗传分化的影响,验证“不稳定性隔离”模型。数据集包含5个文件,覆盖气候稳定性阻力、遗传分化指数、地理坡度阻力等多维度数据。
文件详解
- 文件名称:Climatic_stability_resistances.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含树蛙种群间的气候稳定性阻力值矩阵,行和列均为种群编号(如alian、altog等),矩阵元素为对应种群对的气候稳定性阻力数据。
- 文件名称:PairwiseFst.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含树蛙种群间的成对遗传分化指数(Fst)矩阵,行和列均为种群编号,矩阵元素为对应种群对的Fst值,反映种群间遗传分化程度。
- 文件名称:Geographic_slope_resistances.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含树蛙种群间的地理坡度阻力值矩阵,行和列均为种群编号,矩阵元素为对应种群对的地理坡度阻力数据。
- 文件名称:Geo_distances_pop4ind.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:包含树蛙种群间的地理距离数据,具体字段映射需结合数据内容进一步确认。
- 文件名称:Presence_points_Hlundii.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:包含Hypsiboas lundii树蛙的分布点数据,可能涵盖地理位置、采样信息等内容。
数据来源
论文“Isolation by instability: historical climate change shapes population structure and genomic divergence of treefrogs in the Neotropical Cerrado savanna”
适用场景
- 种群遗传学研究: 利用PairwiseFst.csv分析树蛙种群间的遗传分化程度与结构。
- 古气候生态响应分析: 通过Climatic_stability_resistances.csv探究历史气候波动对树蛙种群分布的影响。
- 景观基因组学研究: 结合地理距离、坡度阻力数据,分析地理与气候因素对基因流的共同作用。
- 生物地理学建模: 利用Presence_points_Hlundii.xlsx的分布点数据,构建树蛙的生境适宜性模型。
- 热带稀树草原生物多样性保护: 基于种群结构与分化数据,为塞拉多特有物种的保护策略制定提供科学依据。