数据集概述
本数据集包含IBSEM生态遗传模型的代码、超参数及运行说明,用于模拟鲑鱼种群动态。代码与参数更新至二零二五年四月二十九日,涵盖模型实现、参数配置和使用指南三类文件,为鲑鱼种群生态遗传研究提供可复现的计算工具支持。
文件详解
该数据集按功能分为代码、参数配置和说明文档三类文件,具体如下:
- 代码文件(位于IBSEM Code and Documentation/IBSEM/code/目录):
- 格式:.cpp、.h
- 核心文件:adultparameters.cpp、adultpopulation.h、individual.cpp、embryopopulation.cpp、generaldefinitions.cpp等,包含模型各模块(成鱼、胚胎、幼鱼等)的逻辑实现与数据结构定义
- 参数配置文件(位于IBSEM Code and Documentation/IBSEM/runFiles/parameters/目录):
- 格式:.txt
- 核心文件:adultParameters.txt、embryoParameters.txt、environmentParameters.txt、riverTemperatures.txt、seaTemperatures.txt等,存储模型运行所需的生物参数与环境变量
- 说明文档(位于IBSEM Code and Documentation/IBSEM/instructions/目录):
- 格式:.docx
- 核心文件:readMe.docx、S1 file.docx、S2 file.docx,提供模型使用指南与补充说明
适用场景
- 鲑鱼种群生态学研究:模拟环境变化对鲑鱼种群数量动态的影响
- 进化生物学分析:探究遗传变异与生态因子的交互作用对鲑鱼适应性进化的驱动机制
- 渔业资源管理:评估不同管理策略下鲑鱼种群的恢复潜力与可持续性
- 计算生态学方法验证:作为生态遗传模型开发与优化的参考实现案例