数据集概述
本数据集包含婆罗洲沙巴地区64个相机陷阱站点的iDNA(水蛭DNA)与相机陷阱同步调查数据,用于通过 occupancy模型分析哺乳动物的存在概率,比较两种方法的监测效果,并验证iDNA在生物多样性评估中的适用性。数据集含12个文件,涵盖输入数据、模型代码、结果文件等。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:README_for_combined_input.docx、README_for_leech_input.docx、README_for_cam_trap_input.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:分别说明组合输入、水蛭iDNA输入、相机陷阱输入数据的背景、结构及使用方法
- 代码类文件
- 文件名称:leech_input.R、cam_trap_input.R、combined_input.R
- 文件格式:R
- 字段映射介绍:用于处理水蛭iDNA、相机陷阱及组合数据的R代码脚本
- 模型输出文件
- 文件名称:model_CT.txt、model_leech.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:相机陷阱和水蛭iDNA数据的occupancy模型参数设置与输出结果,包含存在概率(psi)、检测概率相关参数(alpha、b.eff)等
- 数据类文件
- 文件名称:detections_and_size.csv、all_species_detected.csv
- 文件格式:CSV
- 字段映射介绍:detections_and_size.csv含物种名称、水蛭检测数、相机检测数及体型大小;all_species_detected.csv含物种分类(目、科、种)、俗名及两种方法的检测记录
- 压缩文件
- 文件名称:Weather.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含调查期间的天气数据压缩包
数据来源
论文“Shifting up a gear with iDNA: from mammal detection events to standardized surveys”
适用场景
- 生物多样性监测方法比较: 用于分析iDNA与相机陷阱在哺乳动物监测中的检测效率与存在概率估计差异
- 野生动物种群动态研究: 结合两种方法的检测数据,提升物种存在概率估计的准确性
- iDNA技术应用优化: 探索水蛭iDNA采样方案的标准化设计,提高生物多样性评估的稳健性
- 多源数据整合分析: 验证iDNA与相机陷阱数据在统一统计框架下的整合应用效果
- 热带森林哺乳动物保护: 为热带雨林哺乳动物的长期监测与管理提供技术支持