数据集概述
本数据集基于564种人类细胞表面及分泌蛋白(以免疫球蛋白超家族IgSF为主)的高通量互作筛选结果,包含约380个新发现的蛋白互作(PPI)。数据结合系统发育同源性分析验证,覆盖免疫、神经、代谢等多系统的细胞通讯相关互作网络,为生物学功能研究及药物靶点开发提供资源。
文件详解
- Wojtowicz_et_al_DataS4.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:推测为筛选实验的原始或整理后数据表格,可能包含蛋白互作组合、筛选结果值等核心数据字段
- Wojtowicz_et_al_DataS6.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:包含蛋白互作数据(如PTPRQ、NKG2A等蛋白及其关联数值),呈现以嵌套括号分隔的网络结构,可能记录互作强度或聚类关系
- Wojtowicz_et_al_DataS7.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:推测为补充的互作组数据,内容结构与DataS6类似,记录其他蛋白间的互作关系及相关数值
- Wojtowicz_et_al_DataS8.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:推测为补充的互作组数据,内容结构与DataS6、DataS7一致,扩展记录更多蛋白互作信息
数据来源
论文“A human IgSF cell-surface interactome reveals a complex network of protein-protein interactions”
适用场景
- 细胞通讯机制研究:分析细胞表面蛋白互作网络在免疫、神经等系统中的通讯功能
- 孤儿受体配体鉴定:挖掘未表征“孤儿”受体的潜在结合伴侣
- 药物靶点发现:基于新发现的蛋白互作,筛选可干预的治疗靶点
- 系统生物学网络分析:构建跨生物系统的蛋白互作网络,探究多系统调控机制
- 蛋白质家族功能分析:研究免疫球蛋白超家族(IgSF)蛋白的互作规律及功能关联性