数据集概述
本数据集围绕IL1B⁺肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）的来源及其与头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）复发的关联展开，包含TCGA患者特征、细胞状态比例及细胞标志物等数据，辅以分析代码，为研究炎症性癌症相关成纤维细胞（CAFs）微环境对TAMs的影响提供支持。
文件详解
- 代码文件：
- manuscript code.R：R语言格式，可能包含用于数据分析与可视化的脚本代码
- 数据文件：
- Summary of TCGA patient characteristics.xlsx：Excel格式，记录TCGA数据库中患者的基本特征信息
- Deconvoluted cell state proportion for TCGA patient.xlsx：Excel格式，包含TCGA患者样本中各细胞状态的比例数据
- cellstates_marker.csv：CSV格式，字段包括p_val（P值）、avg_log2FC（平均对数倍变化）、pct.1（细胞群1中基因表达比例）、pct.2（细胞群2中基因表达比例）、p_val_adj（校正后P值）、cluster（细胞簇，如IL1B+ TAM）、gene（基因名称）
适用场景
- 肿瘤微环境研究：分析炎症性CAFs对IL1B⁺ TAMs分化的调控机制
- 癌症复发机制研究：探究IL1B⁺ TAMs与HNSCC复发风险的关联
- 生物标志物筛选：基于细胞标志物数据识别HNSCC预后相关的分子标志物
- 临床数据整合分析：结合TCGA患者特征与细胞状态数据开展生存分析
