数据集概述
本数据集包含与论文“Spatial mapping of rheumatoid arthritis synovial niches reveals specific macrophage networks associated with response to therapy”相关的原始IMC图像,共40个感兴趣区域的目录文件,每个目录含46个TIFF图像,包括34个研究用通道图像和1个细胞分割掩模图像,ImageNb_PatientID.xlsx提供额外信息。
文件详解
- 文件名称:DeLima2023-IMC-RAW.zip
- 文件格式:ZIP(压缩包)
- 内容结构:压缩包内包含40个对应感兴趣区域的目录文件,每个目录含46个TIFF图像文件(34个研究用通道图像、1个细胞分割掩模图像及其他相关TIFF);另包含ImageNb_PatientID.xlsx文件,提供图像编号与患者ID的对应信息。
数据来源
论文“Spatial mapping of rheumatoid arthritis synovial niches reveals specific macrophage networks associated with response to therapy”(De Lima et al. 2023, BioRxiv)
适用场景
- 类风湿关节炎病理机制研究:分析滑膜龛的空间结构及巨噬细胞网络与治疗响应的关联。
- 生物医学成像技术应用:探索IMC技术在自身免疫性疾病组织空间分析中的应用价值。
- 临床治疗效果评估:基于滑膜组织的空间映射数据,研究特定细胞网络对治疗响应的预测作用。
- 医学图像数据挖掘:利用原始IMC图像开展细胞分割、通道特征提取等算法开发与验证。