数据集概述
本数据集为 Inga 属(豆科含羞草亚科)系统发育研究的靶向富集核基因数据,包含通过转录组筛选的264个核基因座的测序结果,经质控后保留194个基因座的25.9万余碱基序列,涉及22种 Inga 物种及外类群,用于提升新热带雨林 Inga 属物种辐射的系统发育分辨率。
文件详解
- 压缩文件包
- 文件名称:Inga_phylogenies.tar.gz
- 文件格式:tar.gz
- 字段映射介绍:推测包含基于靶向富集数据构建的系统发育树相关文件
- 压缩文件包
- 文件名称:INGA.zip
- 文件格式:zip
- 字段映射介绍:推测包含 Inga 属靶向富集核基因研究的综合数据文件
- 压缩文件包
- 文件名称:Inga_sequence.tar.gz
- 文件格式:tar.gz
- 字段映射介绍:推测包含 Inga 属物种的靶向富集核基因序列原始或处理后数据
数据来源
论文“Using targeted enrichment of nuclear genes to increase phylogenetic resolution in the neotropical rain forest genus Inga (Leguminosae: Mimosoideae)”
适用场景
- 植物系统发育研究: 用于解析 Inga 属物种间的进化关系,提升近期物种辐射类群的系统发育分辨率
- 物种进化机制分析: 探究新热带雨林 Inga 属物种快速辐射的进化轨迹与驱动机制
- 群体遗传学研究: 支持 Inga 属广布种(如 I. umbellifera)的种内群体历史分析
- 分子系统学方法验证: 评估靶向富集技术在植物核基因系统发育研究中的应用效果