数据集概述
本数据集为内在无序蛋白在界面形成凝聚体时构象渐变的模拟数据,包含WT、WT_noEL_T260、WT_noEL_T290、HP四个系统的模拟结果。每个系统有5次独立运行的原始数据及平均化数据,还有液滴整体的回转半径平方和非球面度数据,用于研究蛋白凝聚过程中的构象变化。
文件详解
- 独立运行数据文件夹(*_i.zip,i=1-5)
- 文件格式:ZIP
- 内容:含Ree、Rg、resDist子文件夹,记录链端角度分布、回转半径分布、残基距离相关分布等数据,单位为模拟单位。
- 平均化数据文件夹(*_AVG.zip)
- 文件格式:ZIP
- 内容:同独立运行数据结构,数据已转换为SI单位,为5次运行的平均值。
- 液滴数据文件夹(droplet.zip)
- 文件格式:ZIP
- 内容:含各系统5次运行的液滴回转半径平方、非球面度时间演化数据,及5次运行的平均值(AVG_.dat)和标准差(STD_.dat)文件。
- 说明文件(README.txt)
- 文件格式:TXT
- 内容:数据集概述、系统说明、单位转换规则及文件结构解释。
适用场景
- 蛋白质凝聚机制研究:分析内在无序蛋白在界面形成凝聚体时的构象渐变过程。
- 生物物理模拟验证:验证不同系统(有无静电作用、不同温度)下蛋白构象模拟结果的可靠性。
- 蛋白结构动力学分析:利用回转半径、端角分布等数据研究蛋白链的动力学变化。
- 凝聚体物理特性研究:通过液滴的非球面度和回转半径数据,分析凝聚体的物理性质。