数据集概述
本数据集围绕地中海生物多样性热点区的鸢尾属Xiphium亚属展开系统发育研究,基于110个核标记和全质体组序列数据,通过贝叶斯推断和最大似然法重建类群间的系统发育关系,分析了亚属及物种的单系性、拓扑结构冲突及生物地理模式,包含8个相关文件。
文件详解
- 文档类文件
- 文件名称:
README-revised.docx
- 文件格式:DOCX
- 字段映射介绍:数据集说明文档,通常包含研究背景、数据采集方法、文件说明等内容
- 文件名称:
all-partitions.rtf
- 文件格式:RTF
- 字段映射介绍:可能包含系统发育分析中的分区信息或相关注释内容
- 序列与数据集文件
- 文件名称:
Combined280472.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:核标记与质体组组合数据集文件,预览显示包含NEXUS格式的分类单元信息(如ntax=24及taxlabels列表)
- 文件名称:
Nuclear179184.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:110个核标记序列数据集文件
- 文件名称:
Plastome101288.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:全质体组序列数据集文件
- 文件名称:
110NuclearlociAndPlastome.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:110个核标记与全质体组合并的序列数据集文件
- 文件名称:
allGenes208939.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:可能包含所有基因序列的汇总数据集文件
- 分析结果文件
- 文件名称:
topologyTests.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:拓扑结构检验结果文件,包含单系性假设检验等分析数据
适用场景
- 植物系统发育研究: 用于分析鸢尾属Xiphium亚属的系统发育关系、单系性及分类学界定
- 生物地理分析: 探究地中海区域(非洲与欧洲大陆)鸢尾类群的遗传交流模式及直布罗陀海峡的地理屏障作用
- 分子数据整合研究: 比较核标记与质体组数据对系统发育重建结果的影响,分析拓扑结构冲突原因
- 生物多样性热点区研究: 支撑地中海生物多样性热点区内鸢尾属类群的演化与多样性机制分析