数据集概述
本数据集是ISBI2023会议研究“代谢物定量计算可重复性在短回波时间在体磁共振波谱中的应用”的重现结果。通过reprovipgroup仓库脚本与新版cQUEST应用(带溯源元数据功能)生成,包含77个文件,用于验证代谢物定量分析的计算可重复性。
文件详解
- 压缩包文件(.gz)
- 文件名称:遵循
CQUEST.sh-[数字].tar.gz模式(如CQUEST.sh-3433763638658207.tar.gz)
- 文件格式:GZ
- 数量:76个(占比约98.7%)
- 内容:cQUEST应用执行生成的结果文件压缩包
- 元数据文件
- 文件名称:CQUEST.json
- 文件格式:JSON
- 字段映射:包含name(名称)、tool-version(工具版本)、author(作者)、description(描述)、command-line(命令行)、container-image(容器镜像)、schema-version( schema版本)、inputs(输入)、output-files(输出文件)等字段
数据来源
论文“Computational Reproducibility in Metabolite Quantification Applied to Short Echo Time in Vivo MR Spectroscopy”(ISBI2023会议)、https://gitlab.in2p3.fr/reprovipgroup/isbi-spectro
适用场景
- 磁共振波谱代谢物定量可重复性研究: 验证短回波时间在体磁共振波谱中代谢物定量分析的计算可重复性
- 生物医学数据溯源分析: 利用JSON元数据研究科研结果的生成过程与溯源管理
- 学术研究结果重现验证: 基于脚本与新版工具重现原始研究结果,支持科研结果的交叉验证
- 磁共振波谱分析工具优化: 对比不同版本cQUEST应用的结果差异,指导工具版本迭代与性能优化