数据集概述
本数据集围绕核糖体DNA（rDNA）序列异质性展开，包含酿酒酵母（Saccharomyces cerevisiae）及其近缘野生种（Saccharomyces paradoxus）的rDNA变异数据，用于评估rDNA位点特征对种内系统发育推断的影响，验证其作为进化信息来源的价值。
文件详解
- 系统发育树文件（.nex格式）：
- S_paradoxus_tree.nex、S_cerevisiae_tree.nex：存储酵母菌株的种内系统发育树结构数据
- 遗传距离文件（.nex格式）：
- S_cerevisiae_CE_Dist.nex、S_paradoxus_CE_dist.nex：记录菌株间的CE遗传距离数据
- 附录文档：
- West_rDNA_Appendix_1.xlsx、West_rDNA_Appendix_2.xlsx：Excel格式的补充数据表格
- West_rDNA_Appendix_3.pdf、West_rDNA_Appendix_4.pdf：PDF格式的研究附录文档
- West_rDNA_Appendix_3.svg：SVG格式的附录图表
- 脚本文件：
- coverage_v2.pl：Perl脚本，可能用于计算序列覆盖度
适用场景
- 酵母遗传学研究：分析核糖体DNA序列异质性对种内系统发育推断的影响
- 进化生物学分析：探究重复基因组区域单核苷酸多态性（SNPs）在识别杂交事件中的应用
- 基因组结构研究：验证rDNA位点特征与全基因组结构分析结果的一致性
- 生物信息学方法开发：优化基于rDNA序列的近缘生物系统发育树构建方法
