数据集概述
本数据集为Gonzalo-Valmala及同事提交至《Limnology & Oceanography》期刊的研究论文“Grazer-induced bioluminescence and toxicity in marine dinoflagellates”提供支撑,包含甲藻对桡足类酰胺响应的生物发光与毒性实验数据及分析代码。
文件详解
该数据集包含分析代码、数据文件及图片文件,具体如下:
- 分析代码与输出文件:
- Supplementary_Code.Rmd:R Markdown格式,含数据分析与可视化代码,支持统计分析、相关性评估、效应量计算及图表生成的可复现工作流
- Supplementary_Code.html:HTML格式,为R Markdown文件的编译输出,展示代码及执行结果
- 生物发光相关数据文件(CSV格式):
- P.reticulatum_Bioluminescence.csv:用于网纹原角藻生物发光诱导响应的米氏曲线拟合与统计分析,支撑主文稿图1b、d、f生成
- A.catenella_Bioluminescence.csv:用于链状亚历山大藻生物发光诱导响应的米氏曲线拟合与统计分析,支撑主文稿图1a、c、e生成
- Both_species_bioluminescence.csv:用于计算网纹原角藻和链状亚历山大藻生物发光诱导实验的效应量统计量(表3)
- EffectSizeBiolum_Data.csv:用于计算网纹原角藻和链状亚历山大藻生物发光诱导实验的组间效应量(表2)
- 毒性相关数据文件(CSV格式):
- G.catenatum_Toxins.csv:用于链状裸甲藻毒性诱导响应的统计分析,支撑主文稿图2a、c、e生成
- A.catenella_Toxin_Wide.csv:用于链状亚历山大藻毒性诱导响应的统计分析,支撑主文稿图2d、f及补充图S1生成
- A.catenella_Toxins_Long.csv:支撑主文稿图2b生成
- Both_species_Toxins.csv:用于计算链状亚历山大藻和链状裸甲藻毒性诱导实验的效应量统计量(表3)
- EffectSizeTox_Data.csv:用于计算链状亚历山大藻和链状裸甲藻毒性诱导实验的组间效应量(表3)
- 图片文件(PNG格式):
- Alexandrium_catenella_(1).PNG:链状亚历山大藻绘图,用于图1a、2b
- Protoceratium_reticulatum_(1).PNG:网纹原角藻绘图,用于图1b
- Gymnodinium_catenatum_(1).PNG:链状裸甲藻绘图,用于图2a
适用场景
- 海洋生态学研究:分析甲藻对捕食者诱导物的防御响应机制
- 浮游生物生理学研究:探究桡足类酰胺对甲藻生物发光与毒性的调控作用
- 生物统计学应用:基于米氏曲线拟合与效应量分析开展海洋生物实验数据建模
- 环境毒理学研究:评估甲藻毒性变化对海洋生态系统的潜在影响