数据集概述
本数据集为加州金杯栎（Protobalanus组）基因组研究相关数据，包含样本信息、系统发育分析文件及基因变异数据，支撑对其隐存谱系分化与基因渐渗现象的研究。
文件详解
数据集包含一个目录下的八个文件，具体说明如下：
- 样本信息文件：
- Samples.xlsx：Excel格式文件，可能包含实验样本的基础信息
- 系统发育分析文件：
- SNAPP_BER_CAT_SON.nex：NEXUS格式文件，用于系统发育分析
- SNAPP_GAB_CLE_SHA.nex：NEXUS格式文件，用于系统发育分析
- SNAPP_LAG_CRU_TAH.nex：NEXUS格式文件，用于系统发育分析
- 基因变异数据文件：
- STACKS_p5.vcf：VCF格式文件，基因变异数据
- PyRAD_Wclust90.vcf：VCF格式文件，基因变异数据
- STACKS_p10.vcf：VCF格式文件，基因变异数据
- PyRAD_Wclust85.vcf：VCF格式文件，基因变异数据
数据来源
New Phytologist期刊发表的《Genomic data reveal cryptic lineage diversification and introgression in Californian golden cup oaks (section Protobalanus)》研究
适用场景
- 植物基因组学研究：分析加州金杯栎的谱系分化机制
- 进化生物学研究：探究物种间基因渐渗现象
- 生物信息学分析：验证基因组数据处理工具（如STACKS、PyRAD）的效果
- 植物分类学研究：辅助隐存物种的鉴定与分类
