数据集概述
该数据集基于CRAFTseq技术,整合CRISPR编辑细胞的转录组、基因组DNA和表面标志物的单细胞测序数据,用于定义PTEN、FBXO11、HLA-DQB1等基因疾病变异的功能,支持相关细胞系实验分析。
文件详解
- 压缩文件(.zip格式):
- DQB1_Data_Analysis.zip:HLA-DQB1基因相关分析数据压缩包
- PTEN_Data_Analysis.zip:PTEN基因相关分析数据压缩包
- FBXO11_Data_Analysis.zip:FBXO11基因相关分析数据压缩包
- 表格数据文件(.csv格式):
- PlateMeta2Full.csv:包含Condition、Barcode_RNA、Barcode_ADT、Barcode_DNA等字段,记录样本条件与多模态测序 barcode 对应关系
- RNA_ADT_Barcodes.csv:包含Well_ID、RNA_cell等字段,记录细胞孔位与RNA测序 barcode 对应关系
适用场景
- 疾病相关基因功能研究:分析PTEN、FBXO11、HLA-DQB1变异对细胞功能的影响
- 单细胞多组学技术应用:探索CRISPR编辑与转录组、基因组、蛋白组多模态测序的整合分析方法
- 基因编辑效果评估:研究CRISPR编辑后细胞的分子表型变化
- 生物信息学方法开发:基于多模态单细胞数据开发疾病相关基因的分析算法