数据集概述
该数据集与研究论文《Polar lake microbiomes have distinct evolutionary histories》相关，包含极地湖泊微生物组进化研究的补充文件、分析代码及序列比对数据。数据集通过多文件夹组织，涵盖高分辨率图表、R语言分析脚本及微生物序列比对文件，为研究极地湖泊微生物的进化特征提供数据支持。
文件详解
数据集由多个文件夹及文件组成，具体说明如下：
- 高分辨率图表文件（位于High-resolution figures/目录下）：
- 文件格式：PNG（.png）
- 内容示例：FigS6_barplots_euk.png（真核生物柱状图）、figS2_phylo_bac_600.png（细菌系统发育图）、FigS1_CAP.png（约束对应分析图）等，共15个图表文件
- R语言代码文件（位于R-code/目录下）：
- toy_sample_GAM.Rmd：R Markdown格式文件，用于演示平滑函数的示例代码
- script_mean_richness.R：R脚本文件，用于计算样本平均丰富度
- 序列比对文件（位于Alignments/目录下）：
- 全序列比对文件（Full alignments/子目录）：FAS格式（.fas），包含Dinoflagellata、Metazoa、Stramenopiles等类群的微生物序列比对数据，共16个文件
- 短序列比对文件（Short alignments/子目录）：FAS格式（.fas），包含Streptophyta、Fungi、Ochrophyta等类群的微生物短序列比对数据，共15个文件
数据来源
Science Advances（论文DOI：10.1126/sciadv.ade7130）
适用场景
- 微生物进化研究：分析极地湖泊微生物类群的系统发育关系与进化历史
- 生物信息学分析：基于序列比对数据开展微生物分类与多样性研究
- 生态学研究：探究极地环境对微生物群落结构的影响机制
- 数据复现：复现论文中样本丰富度计算、平滑函数分析等实验结果
