数据集概述
本数据集为截短植物血红蛋白对氰酰胺的类过氧化氢酶活性研究提供支持,包含实验数据(如ABTS假过氧化物酶、EPR光谱、UV-vis光谱)、分子对接文件及DFT计算结果,覆盖论文及补充材料核心图表的可编辑资源。
文件详解
数据集包含Excel文档、分子对接文件及DFT计算结果三类文件,具体如下:
- Excel文档(共6个):
- ABTS_pseudoperoxidase.xlsx:支持论文图4及补充材料图S4、S5的实验数据
- EPR_data.xlsx:支持论文图3及补充材料图S1、S8、S9的可编辑EPR光谱资源
- Figure5_all_spectra.xlsx:可编辑的对照UV-vis光谱数据
- metAt3_CA_px_Figure2.xlsx:支持论文图2的可编辑UV-vis光谱数据
- metAt3_CN+px2_FigureS7.xlsx:支持补充材料图S7的可编辑UV-vis光谱数据
- metAt3_px_CA_FigureS3.xlsx:支持补充材料图S3的可编辑UV-vis光谱数据
- 分子对接文件(Autodock格式):
- .dlg文件:需通过AutodockTools软件打开,结合.pdbqt蛋白文件查看结合位点、亲和力及评分
- At3_NH2CN.pdbqt、Hb_NH2CN.pdbqt:可通过ChimeraX软件加载,查看论文描述的蛋白结合位点
- DFT计算结果(位于DFT_calculations文件夹):
- .spartan文件:各氰酰胺连接异构体及自旋态的计算文件,需通过Spartan软件打开
- .log文件(文本格式):氰酰胺(低自旋加合物)与结合位点氨基酸氢键作用的计算结果,可通过GaussView或文本阅读器查看
适用场景
- 生物化学研究:分析截短植物血红蛋白的催化活性及酶促反应机制
- 结构生物学研究:探究蛋白质与氰酰胺的分子相互作用及结合模式
- 计算化学研究:复现或扩展DFT计算以评估氢键作用及异构体稳定性
- 实验数据验证:支持论文及补充材料中光谱、酶活性等实验结果的复现与分析