激活网络分析数据集

数据集概述

本数据集包含用于激活网络分析的关键数据文件,涵盖基因表达数据、基因共表达相关性数据及代谢物敲除通量谱数据,为相关生物学网络分析提供基础数据支持。

文件详解

  • 文件名称: metabolite_KO_output_GEM9.txt
  • 文件格式: TXT (.txt)
  • 内容说明: 包含计算机模拟代谢物敲除的通量谱数据,预览内容显示为以"r_0001"开头的数值序列。
  • 文件名称: gene_expression_all_genome2.Rdata
  • 文件格式: R数据文件 (.Rdata)
  • 内容说明: 从ArrayExpress数据库获取的genome2芯片微阵列数据,包含处理后的基因表达数据。
  • 文件名称: gene_expression_all_avgConditionWise_genome2.Rdata
  • 文件格式: R数据文件 (.Rdata)
  • 内容说明: 对同一条件下不同研究的样本表达数据进行平均处理后的文件,用于避免高度研究条件的偏差。
  • 文件名称: gene_co_expression_avgConditionWise_correlation.Rdata
  • 文件格式: R数据文件 (.Rdata)
  • 内容说明: 基于平均后基因表达数据计算的基因共表达相关性数据,包含相关性检验结果。

适用场景

  • 生物信息学研究: 用于分析基因表达模式及基因共表达网络
  • 系统生物学分析: 支持代谢网络模型构建与代谢物功能预测
  • 计算生物学模拟: 可用于验证代谢物敲除对生物系统的影响
  • 基因调控机制研究: 探索基因表达与代谢通路的关联关系
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 561.9 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。