数据集概述
本数据集包含支持己酮可可碱（PTX）促进金黄色葡萄球菌适应性研究的原始数据，涉及基因表达、热力学、酶学、胞内小分子水平、微生物生长竞争、毒力表型及感染实验等多维度数据，为非抗生素药物影响细菌进化的机制研究提供支持。
文件详解
该数据集按实验类型分类存储，具体文件说明如下：
- 1Gene Alignment and Expression Data/ 目录：
- RT-qPCR Original Ct Value Data.xlsx：RT-qPCR原始Ct值数据，Excel格式
- genome sequence/ 子目录：包含L1.gbk、L2.gbk、L3.gbk等基因组序列文件（.gbk、.dna格式）
- Phylogenetic Tree Reference Genomes/ 子目录：包含多个.clc格式的系统发育树参考基因组文件（共四十五个）
- 2Thermodynamics and Enzymology Data/ 目录：
- Growth Curves Under PTX Pressure Original Counts.xlsx：PTX压力下生长曲线原始计数数据，Excel格式
- Isothermal Titration Calorimetry (ITC) Original Thermodynamic Data.apj：等温滴定量热法原始热力学数据，.apj格式
- GdpP Enzyme Activity Original Measurement Data.xlsx：GdpP酶活性原始测量数据，Excel格式
- 3Intracellular Small Molecule Level Data/ 目录：
- c-di-AMP Measurement Original Data.xlsx：胞内c-di-AMP测量原始数据，Excel格式
- ATP Measurement Original Data.xlsx：ATP测量原始数据，Excel格式
- 4Microbial Growth and Competition Data/ 目录：
- Competition Experiment Original Data.xlsx：竞争实验原始数据，Excel格式
- Cell Co-incubation Original Counts.xlsx：细胞共培养原始计数数据，Excel格式
- 5Virulence-Related Phenotype Data/ 目录：
- Staphyloxanthin Absorbance Measurement Original Data.xlsx：葡萄球菌黄素吸光度测量原始数据，Excel格式
- Biofilm Absorbance Measurement Original Data.xlsx：生物膜吸光度测量原始数据，Excel格式
- 6Infection Experiment Data/ 目录：
- IL-1 Beta Measurement Original Data.xlsx：IL-1β测量原始数据，Excel格式
- Mouse Organ Bacterial Burden Count Original Data.xlsx：小鼠器官细菌载量计数原始数据，Excel格式
适用场景
- 细菌适应性机制研究：分析己酮可可碱对金黄色葡萄球菌进化的影响
- 非抗生素药物抗菌作用研究：探索非抗生素药物通过调控第二信使影响细菌的机制
- 金黄色葡萄球菌毒力及感染机制研究：基于毒力表型及感染实验数据开展相关分析
- 微生物酶学及热力学特性研究：利用酶活性、等温滴定量热法等数据进行机制解析
- 基因表达与胞内小分子关联分析：结合基因表达与c-di-AMP、ATP水平数据探究信号通路调控
