数据集概述
本数据集基于线粒体与核DNA序列数据，通过贝叶斯系统发育推断构建鸡形目225种现存物种的时间校准分子系统发育树，探讨其白垩纪起源、白垩纪-古近纪灭绝事件后的幸存支系及多样化速率变化模式。
文件详解
- 说明文档（PDF格式）：
- README_for_Stein et al 2015 - BEAST xml file for taxon-complete analyses.pdf：含全类群分析BEAST XML文件说明
- README_for_Stein et al. 2015 - BEAST xml file for taxon set with molecular data.pdf：含分子数据类群BEAST XML文件说明
- 分析配置文件（XML格式）：
- Stein et al. 2015 - BEAST xml file for simulation of the calibrated tree prior on the MCC tree from analysis of the taxon set with molecular data.xml：校准树先验模拟配置文件
- Stein et al. 2015 - BEAST xml file for taxon set with molecular data.xml：分子数据类群分析配置文件
- Stein et al 2015 - BEAST xml file for taxon-complete analyses.xml：全类群分析配置文件
- 系统发育数据文件：
- Stein et al. 2015 Fig. 1.nex：NEXUS格式系统发育图数据
- Stein et al. 2015 Fig. 1.tre：树文件格式系统发育图数据
适用场景
- 鸟类系统发育研究：用于鸡形目物种演化时间线与亲缘关系分析
- 灭绝事件幸存机制研究：探讨白垩纪-古近纪灭绝事件对鸟类支系的影响
- 生物多样化速率分析：研究鸡形目演化过程中的多样化速率变化模式
- 分子系统发育方法验证：验证贝叶斯推断与时间校准模型在大型类群中的应用效果
