数据集概述
本数据集是论文《Using the Gene Ontology tool to produce de novo protein-protein interaction networks with IS_A relationship》的补充资源，包含基于基因本体（GO）构建的10种生物及其质粒的蛋白质相互作用（PPI）网络数据，网络边权重由基因座对数距离计算，未按String数据库筛选真阳性。
文件详解
- 文件名称: Gene_Ontology_de_novo_PPI.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 内容说明: 包含论文提及的10种生物及其质粒的蛋白质相互作用网络数据，边权重基于染色体基因座对数距离计算，未限制为String数据库真阳性，而是包含所有具有三个GO类别共性的蛋白质候选关系对
- 文件名称: Escherichia_coli_S88_p1.png
- 文件格式: PNG图片
- 内容说明: 展示"Escherichia_coli_S88_p1.dot"文件数据的可视化图，对应论文图1，呈现大肠杆菌S88菌株质粒p1的蛋白质相互作用网络结构
适用场景
- 生物信息学研究: 分析基于基因本体构建的蛋白质相互作用网络结构与特性
- 分子生物学分析: 探究基因座位置对蛋白质相互作用网络边权重的影响机制
- 网络可视化工具测试: 为GEPHI等可视化工具提供符合格式要求的网络数据
- 蛋白质组学研究: 辅助研究特定生物（如大肠杆菌）的蛋白质相互作用模式
