数据集概述
本数据集围绕蛋白质修饰发现展开，包含SAMPEI算法的基准测试、巨噬细胞化学蛋白质组学分析及衣康酸加合物验证三类文件，支持蛋白质修饰识别方法的评估与应用研究。
文件详解
- 基准测试文件：
- Agnostic_discovery_benchmarking.zip：ZIP格式，含无偏PTM发现的敏感性与特异性分析数据，对应原文图2、图S3
- 1_Agnostic_discovery_benchmarking_Experimental_design.pdf：PDF格式，基准测试实验设计说明文档
- 巨噬细胞分析文件：
- Chemoproteomics_of_LPS_stimulated_macrophages.zip：ZIP格式，含RAW264.7细胞蛋白质组学识别结果（X!tandem与SAMPEI），对应原文图3、图S4-S7
- 2_Chemoproteomics_of_LPS_stimulated_macrophages_Experimental_design.pdf：PDF格式，巨噬细胞实验设计说明文档
- 加合物验证文件：
- Itaconate_adducts_validation.zip：ZIP格式，含衣康酸半胱氨酸加合物验证分析数据，对应原文图5、图S8-S12
- 3_Itaconate_adducts_validation_Experimental_design.pdf：PDF格式，加合物验证实验设计说明文档
- 元数据文件：
- 0_Datasets_metadata.xlsx：XLSX格式，数据集元数据信息
适用场景
- 蛋白质修饰识别算法性能评估
- 巨噬细胞活化过程蛋白质组学分析
- 衣康酸介导的蛋白质修饰机制研究
- 无偏蛋白质翻译后修饰发现方法开发
- 质谱蛋白质组学数据处理流程优化
