数据集概述
本数据集包含小鼠海马神经细胞中Peg13、Trappc9、Ago2等印记基因簇的等位基因表达分析数据，涉及5' RACE测序、组织/单细胞等位基因偏向性检测、基因调控元件功能验证及甲基化分析等实验结果，共35个文件，支持神经细胞基因印记表达机制的研究。
文件详解
- 等位基因表达测序数据文件
- 文件名称样例：30-04-21 Ago2 1st NS Fig5.zip、08-03-21 Peg13 Fig3.zip、26-01-21 Trappc9 Fig4.zip、18-06-21 Ago2 NSC Fig5.zip、23-12-20 Ago2 NSC Fig5.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：包含单神经干细胞（NSC）或分化神经元中Peg13、Trappc9、Ago2转录本的Sanger测序数据，通过SNP检测分析等位基因表达来源（母源/父源）
- 调控元件功能分析文件
- 文件名称：Glomax reads of primary neurons with brain specific regulatory elements Fig 6.zip、pGL plasmids Fig 6.zip
- 文件格式：ZIP
- 内容说明：含脑特异性调控元件与Trappc9启动子共转染后的荧光素酶表达数据（Glomax检测结果），以及用于转染的pGL质粒载体相关数据
- 细胞鉴定数据文件
- 文件名称：Cell identifier Ct values Suppl Fig 2.pptx
- 文件格式：PPTX
- 内容说明：包含单神经干细胞及分化神经元中神经细胞类型特异性基因的qPCR Ct值数据，用于细胞命运鉴定及分析其对等位基因表达的影响
适用场景
- 神经细胞印记基因表达机制研究：分析Peg13-Trappc9-Ago2簇基因在单神经细胞中的等位基因偏向性表达特征
- 基因转录起始位点分析：通过5' RACE测序数据研究Trappc9基因的可变转录起始位点
- 脑特异性调控元件功能验证：探究调控元件对Trappc9启动子活性的影响及细胞类型特异性
- 神经细胞命运与基因表达关联分析：结合细胞鉴定Ct值数据，研究细胞分化状态对等位基因表达的调控作用
- 基因甲基化与表达调控研究：支持CpG岛甲基化状态与印记基因表达相关性的分析（基于亚硫酸氢盐转化测序数据）
