数据集概述
本数据集是一套用于鉴定ERBB受体拮抗剂特性的实验方案,基于条形码ERBBprofiler实验,覆盖溶液转染、细胞处理、样本联合处理、PCR扩增与索引、测序及数据分析等步骤,可同时评估化合物效应与细胞类型依赖效应。
文件详解
该数据集包含多个目录及文件,具体说明如下:
- 图表文件(位于Figure 3/、Figure 4/目录下):
- Figure 3.txt、Figure 4B.txt、Figure 4C.txt、Figure 4D.txt等: TXT格式,可能包含图表对应的实验数据(如活性、浓度、标准误等字段)
- 补充说明文件(位于Supplemental Note/目录下):
- Supplemental Note.pdf: PDF格式,提供实验方案的补充说明文档
- 代码文件(位于Code/目录下):
- DRC R script目录: 包含DRC-script.R(R脚本)、DRC-script.txt、COMPOUND-Receptor1.txt、COMPOUND-Receptor2.txt等,用于剂量反应曲线分析
- Heatmap R script目录: 包含Heatmap-script.R(R脚本)、Heatmap-script.txt、HEATMAP.txt等,用于热图分析
适用场景
- 癌症研究: 分析ERBB家族受体拮抗剂对肿瘤细胞信号通路的影响
- 药物研发: 评估ERBB受体拮抗剂的药理特性与细胞类型依赖效应
- 分子生物学实验: 复现基于条形码ERBBprofiler实验的化合物筛选流程
- 生物信息学分析: 应用配套R脚本进行剂量反应曲线与热图数据处理