数据集概述
该数据集包含用于研究新热带慈鲷(Cichliformes: Cichlidae: Cichlinae)系统发育的外显子序列比对文件和带自举值的最大似然系统发育树,仅纳入每个分类群至少100bp的外显子数据,为分析该类群系统发育关系及冲突分支提供数据支持。
文件详解
该数据集包含一个目录及两个压缩文件,具体说明如下:
- 目录: Data for Exon-based phylogenomics strengthens the phylogeny of Neotropical cichlids and identifies remaining conflicting clades (Cichliformes Cichlidae Cichlinae)/
- 压缩文件:
- Ilves_etal.2017.MPE_Alignments.zip: ZIP格式压缩文件,包含所有符合长度要求的外显子序列比对数据。
- Ilves_etal.2017.MPE_BootstrappedMLtrees.zip: ZIP格式压缩文件,包含基于最大似然法构建并经过自举检验的系统发育树数据。
适用场景
- 鱼类系统发育研究: 用于构建和验证新热带慈鲷类群的系统发育关系,分析分类单元间的演化历史。
- 分子进化分析: 基于外显子序列数据探究新热带慈鲷的分子进化模式与速率。
- 生物多样性研究: 为新热带慈鲷的物种分类、生物地理分布及多样性形成机制研究提供系统发育依据。
- 系统基因组学方法验证: 可用于评估外显子数据在解决复杂类群系统发育冲突中的应用效果。