数据集概述
本数据集包含用于莎草疫霉（Phytophthora cyperi）系统发育分析的相关文件，基于线粒体cox1基因序列，涵盖序列登录信息、序列比对文件及IQ-TREE 2、PartitionFinder2、MrBayes 3.2.6等工具的分析输出，为该物种的系统发育研究提供数据支持。
文件详解
该数据集包含多个目录及文件，具体说明如下：
- 根目录文件
- sequence_accessions.xlsx：Excel格式文件，包含序列登录信息
- cox1.95x1344.phy：PHY格式文件，线粒体cox1序列比对数据
- IQ-TREE 2 output目录文件
- cox1.95x1344.nex系列文件：包含最佳模型、日志、进化树等系统发育分析结果
- MrBayes output目录文件
- cox1.95x1344.nex系列文件：包含贝叶斯系统发育推断的参数、进化树等输出
- PartitionFinder output目录文件
- best_scheme.txt：TXT格式文件，记录最佳分区方案
- partition_finder.cfg：配置文件，PartitionFinder2分析参数设置
适用场景
- 真菌系统发育研究：用于莎草疫霉及相关物种的系统发育关系分析
- 分子生物学研究：基于线粒体cox1基因序列的物种鉴定与分类
- 进化生物学分析：探究疫霉属物种的进化路径与亲缘关系
- 生物信息学方法验证：对比不同系统发育分析工具（如IQ-TREE、MrBayes）的结果差异
