数据集概述
本数据集围绕USP5蛋白锌指泛素结合域(Zf-UBD)的已知结晶化合物,通过子结构搜索、虚拟筛选及自由能微扰(FEP)技术,识别并优先排序可商用的化学类似物。包含多种格式的筛选结果与化合物列表文件,为药物发现中活性化合物的扩展研究提供数据支持。
文件详解
该数据集由10个文件组成,具体说明如下:
- 核心筛选结果文件(.icb格式,共7个):
- selectedcpdafterdocking_FEP.icb:可能包含经对接和FEP分析后的化合物筛选结果
- DAT180_substructuresearchEmolecule_GLIDEdocking_selection.icb:基于Emolecule子结构搜索及GLIDE对接的DAT180化合物筛选结果
- DAT201_substructuresearchMolPort_GLIDEdocking_selection.icb:基于MolPort子结构搜索及GLIDE对接的DAT201化合物筛选结果
- DAT180_substructuresearchMolPort_GLIDEdocking_selection.icb:基于MolPort子结构搜索及GLIDE对接的DAT180化合物筛选结果
- DAT201_substructuresearchEmolecules_GLIDEdocking_selection.icb:基于Emolecules子结构搜索及GLIDE对接的DAT201化合物筛选结果
- DAT194_substructuresearchEmolecules_GLIDEdocking_selection.icb:基于Emolecules子结构搜索及GLIDE对接的DAT194化合物筛选结果
- 化合物列表文件(.sdf格式,共2个):
- Molport_cpd_list.sdf:MolPort平台的化合物列表文件,包含化合物结构信息
- Emolecules_cpd_list.sdf:Emolecules平台的化合物列表文件,包含化合物结构信息
- 文档文件(.pdf格式,共1个):
- 20181116_hitexpansion.pdf:可能为命中扩展研究的相关报告或说明文档
适用场景
- 药物化学研究:用于USP5蛋白抑制剂的类似物设计与活性预测
- 虚拟筛选方法验证:评估子结构搜索结合GLIDE对接在化合物筛选中的应用效果
- 计算生物学分析:探究自由能微扰技术在化合物优先级排序中的准确性
- 药物发现应用:为靶向USP5蛋白的新型小分子药物研发提供候选化合物库支持