Juglandaceae_Based_胡桃科异源四倍体起源基因组结构分析及系统发育信号数据

数据集概述

本数据集包含胡桃科异源四倍体起源的基因组结构分析相关数据,涉及微共线性、基因含量等系统发育分析文件,以及说明文档。数据用于支持胡桃科起源于杨梅科内已灭绝或未采样祖先的杂交起源研究,揭示基因组结构中的系统发育信号,共包含二十五份文件。

文件详解

  • 说明文档
  • 文件名称:README.docx
  • 文件格式:DOCX
  • 字段映射介绍:数据集说明文档,包含数据背景、文件说明等内容
  • 微共线性分析文件
  • 文件名称:遵循Microsynteny_*_subgenome_*.phy模式(例如:Microsynteny_Collinear_blocks_Dominant_Recessive_subgenome_A10Gm25.phy)
  • 文件格式:PHY
  • 字段映射介绍:包含基于显性/隐性亚基因组、同源染色体的共线性块微共线性分析数据,用于系统发育信号研究
  • 基因含量分析文件
  • 文件名称:遵循Genecontent_Homoeologous_Chromosomes_*_subgenome.phy模式(例如:Genecontent_Homoeologous_Chromosomes_Recessive_subgenome.phy)
  • 文件格式:PHY
  • 字段映射介绍:包含显性/隐性亚基因组同源染色体的基因含量数据,用于亚基因组差异及系统发育分析

数据来源

论文“Genome-structural analyses support an allotetraploid origin of the walnut family from within Myricaceae and shared genome duplications reveal substitution rate variation”

适用场景

  • 胡桃科系统发育研究: 利用微共线性和基因含量数据,分析胡桃科物种的系统发育关系及亚基因组分化
  • 异源四倍体起源分析: 验证胡桃科起源于杨梅科内祖先杂交的假说
  • 基因组结构系统发育信号研究: 挖掘基因组结构中未被充分利用的系统发育信息
  • 分子进化速率分析: 基于基因含量数据研究胡桃科物种的DNA修复相关基因比例及进化速率差异
  • 分子钟假说验证: 为分子钟假说提供基因组结构层面的证据支持
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 12.54 MiB
最后更新 2026年1月12日
创建于 2026年1月12日
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