数据集概述
该数据集为K. Eastman论文第3、4章的补充数据与图表,包含异常值分析、同源基因注释、差异表达结果、KEGG富集分析、共表达网络及主成分分析图表等内容,为论文核心研究提供支撑。
文件详解
- 补充数据文件(共9项):
- S1 Outliers:未说明格式,内容为异常值相关数据
- S2 Setaria orthologs and OG phylogeny notes:未说明格式,内容为狗尾草同源基因及直系同源群系统发育注释
- S3 DE results:未说明格式,内容为差异表达分析结果
- S4 KEGG summary:未说明格式,内容为KEGG通路分析摘要
- S5 inc DEG KEGG enrich:未说明格式,内容为上调差异表达基因的KEGG富集分析
- S6 herbivory comparison KEGG enrich:未说明格式,内容为食草动物对比实验的KEGG富集分析
- S7 green foxtail coexpression:未说明格式,内容为青狗尾草共表达网络数据
- S8 maize coexpression:未说明格式,内容为玉米共表达网络数据
- S9 SFRP1 BAW KEGG summary:未说明格式,内容为SFRP1基因与秋粘虫实验的KEGG通路分析摘要
- 图表文件(共2项):
- SF1 - PCA 4h 24h samples.png:PNG格式,内容为包含4小时和24小时时间点样本的主成分分析图
- SF2 - PCA SFRP1 WT 4h 24h samples.png:PNG格式,内容为包含SFRP1样本、野生型样本及4小时和24小时时间点的主成分分析图
适用场景
- 分子生物学研究:支持植物基因表达、通路富集及共表达网络相关分析
- 论文成果验证:为K. Eastman论文第3、4章的研究结论提供补充数据支撑
- 生物信息学分析:可用于同源基因注释、差异表达验证等分析场景
- 可视化辅助:主成分分析图表可辅助理解样本分组及处理时间点的影响